O ponto de contato de um filamento de DNA superenrolado onde ele volta para si mesmo. Um nó e a contração do DNA podem ser positivos ou negativos; é positivo se, quando visto de modo que o fio entre no nó de baixo e saia de cima, e a curva mais curta entre a entrada e a saída do fio seja no sentido horário. Nós negativos são formados a partir de DNA negativamente superenrolado. Um nó no DNA é visto quando três nós do mesmo sentido, por exemplo, todos negativos, ocorrem juntos; isso é visto nas micrografias eletrônicas como uma estrutura de trevo, um nó a partir do qual se estendem três voltas de DNA.