Manaphy je malý, modrý, vodné Pokémon. Má zavalité nohy a klub-ako zbrane, ktoré sú dlhšie ako jeho telo. Manaphy má červený drahokam na jeho hrudi a žltou bodkou pod gem. Manaphy má hlavu v tvare cibule s dvojicou dlhých modrých antény, ktoré majú malé gule na konci. Manaphy kosatce sú tmavo modrá, hoci okrajové časti jeho oči sú žlté, s dvoma žlté bodky označenia "obočie" rozširuje z očí. Osemdesiat percent Manaphy jeho telo je vyrobené z vody a je veľmi citlivý na svoje prostredie. , Jeden z týchto reakcií je, že keď Manaphy preberá v oceáne, ktorá je teplejšia než tie, ktoré sú pôvodné na, dieťa bude Phione oproti iným Manaphy.